일본 외딴 섬마을의 작은 신사 고코구. 감독은 수십 마리의 고양이가 머무는 곳으로도 유명한 이 신사를 찾아 마을 사람들과 고양이가 어떻게 함께 살아가는지 관찰한다. 언뜻 고양이와 주민들은 잘 지내는 것처럼 보이지만, 위생과 안전 등을 이유로 고양이를 경계하는 사람들도 적지 않다.