의문의 살인사건이 일어나고 FBI에서는 유력한 용의자로 ‘아이리스’를 지목한다. 아이리스 또한 자신의 주변에서 일어나는 사건에 대해 의구심을 품고 있던 중 MI6 요원이 자신의 행적을 쫓고 급기야 목숨을 위협하기에 이르자 사태의 심각성을 알게 된다. 아이리스는 잊고 지냈던 과거의 기억을 떠올리고, FBI와 MI6 요원들이 자신을 추적하는 것이 비밀리에 진행되었던 ‘하이드 프로젝트’와 연관되어 있다는 것을 알게 되는데...