먼 우주 기계생명체들이 사는 혹성 사이버트론. 그 곳에서 오토봇과 디셉티콘들의 전쟁은 오랜시간 지속되어 왔다. 유니크론에 의해 불멸의 전사로 다시 태어난 디셉티콘들은 사이버트론 행성을 장악했고, 오토봇들은 고향인 사이버트론을 되찾으려고 한다. 유니크론의 명령으로 오토봇들을 공격하기 시작하고 메가트론은 치열한 전투 끝에 옵티머스 프라임을 제거한다. 옵티머스 프라임은 후계자로 핫 로드를 선택하고 핫로드는 새로운 지도자 로디머스 프라임으로 다시 태어난다. 매트릭스를 얻은 로디머스 프라임과 오토봇들은 사이버트론을 되찾고 폭주하는 유니크론을 막기 위해 전쟁을 시작한다.