23세기의 달. 오래전 인류가 지구로부터 이주한 이래, 지구는 빈발해진 이상기상 현상에 의해 이미 멸망했다고 전해진다. 당시의 달에는 100만명 규모의 도시가 건설되어 있었고, 달에 남겨진 이들은 공화국의 건국을 선언하였다. 돔으로 둘러싸인 공화국 EDEN은 인류의 유일한 보금자리라 불리는 평화로운 도시 국가였고, 단 한 명의 소년을 제외한 사람들은 오늘도 평소와 다름없는 삶을 살아가고 있었다. 그 소년, 타케루는 생각한다. "과학 기술 연구의 자유"와 "지구로의 여행의 자유"가 금지된 현재의 EDEN 사회는 어딘가 이상하다고...