세월이 흘러 빌리 펠저와 케이트 베린저는 킹스턴의 작은 마을을 떠나 뉴욕의 맨하탄으로 온다. 그곳에서 그들은 거대한 사업체를 운영하는 다니엘 클램소유의 최첨단 하이테크 건물인 클램타워에서 일하게 된다. 뉴욕이라는 도시의 화려함과 함께 클램 사장은 최신 건물의 근처에 위치한 초라하고 지저분한 건물을 헐어버릴려고 하지만 그들의 반대에 부딪힌다. 그 와중에서 기즈모가 발견되는데, 그 동물의 정체를 알고있는 빌리와 게이트는 놀라서 기즈모를 빼돌린다. 그러나 서랍에 숨겨둔 기즈모는 청소부의 실수로 물에 닿아 그렘린으로 변하는데, 전기 그렘린, 배트맨 그렘린등 각종 장난꾸러기 그렘린으로 변한다. 그들의 등장으로 유전공학 연구소는 발칵뒤집히고 결국 빌리와 게이트는 햇빛을 이용하여 그렘린을 처치하고 클램사장의 음모도 저지된다.