낯선 세상에서 깨어난 ‘소라’. 또 다른 프리큐어인 ‘유이’와 ‘마나츠’와 함께 이곳에 대한 단서를 찾던 중, 프리큐어로 변신해 싸우던 소녀, ‘프림’과 만난다. 한편, ‘소라’와 떨어진 ‘마시로’와 동료들은 각각 다른 장소에서 프리큐어들을 만나고, 이 세상에는 프리큐어밖에 없다는 걸 깨닫는다. 자신들의 세상으로 돌아가기 위해 프리큐어들은 힘을 합쳐 유일한 단서인 성을 향해 가는데… 이 세계의 비밀을 찾아서! 프리큐어들이 떠나는 대모험이 펼쳐진다!