너무 낡아 더 이상 움직일 수 없게 된 증기 기관차 야에몽. 도쿄 역의 한 구석에 있는 창고에 방치된 야에몽은 역에서 방해물 취급만 받는다. 야에몽을 따르는 건 오직 야에몽 안에서 살고 있는 쥐 형제들과 까마귀 까스케뿐이다. 어느 날, 역에서는 결국 야에몽을 없애기로 결정하는데…