미국 군수뇌부의 특명을 받고 치커리함장이 지휘하는 미잠수함 카퍼핀호가 출항을 한다. 카퍼핀 호엔 , 19살의 신참 토미, 마이크 , 항시 여자 이야기를 하는 울프등 개성강한 선원들과 더불어 익살맞은 나이든 수병 주방장이 타고있다 . 카퍼핀 호의임무는 홉스 제독이 이끄는 항공모함함대에 앞서 동경폭격에 필요한 정보를 캐기위해 중간 경유지인 알루샤섬에서 도쿄태생인 레이몬드 중위를 태우던중 일본전투기를 만나 격추시키고 그와중에 일본 조종사를 끌고나오던 마이크가 일본조종사의단도에 죽게된다, 토미는 죄책감에 빠지고 함장과 함께 잠수함 선미에 박힌 불발탄을 제거를 하면서 차츰 잠수함에 적응한다, 이때즈음 레이몬드와 울프는 일본해안에 침투하여 동경 폭격에 필요한 정보를 입수한채 구사일생으로 미해군 함대에 이를 알리고 , 반격을 가하는 일본구축함을 격침시킨채 무사히 귀항을 하게된다.