악명높은 일본의 만주관동군 사령부 휘하엔 화학무기를 개발하기 위한 731특수부대가 있었는데, 이 부대는 잔혹한 생체실험을 위해 중국인과 한국인을 실험도구로 사용한 마루타(통나무) 부대이다. 일본군에 저항하는 중국 게릴라 부대장이었던 강대량은 배신한 부하로 인해 진지를 기습당하고 아들 남조를 부하에게 맡기며 도망을 간다. 남조는 마루타부대에 넘겨져 철저한 일본식 교육을 받으며 자란다. 일본군 대장은 중국인인 남조를 잔혹한 생체실험을 보여주며 극악한 일본군 대장은 중국인인 남조를 잔혹한 생체실험을 보여주며 극악한 일본군 앞잡이로 만들어 만주경비대장으로 임명한다. 그러나 마적으로 가장한 일본낭인들의 기차습격으로 아내를 잃은 남조는 점점 일본군에 대해 반발을 느끼고...회의를 느낀 남조는 게릴라 부대와 함께 마루타부대와 결투를 벌이던 중 친아버지 강대량을 만나고 731부대는 최후를 맞이한다.