통합군의 파일럿인 신 쿠도우는 남태평양의 한 섬에 불시착한다. 그 섬은 문명을 받아들이지 않은 섬으로 통합군과 비통합군 사이에 벌어지고 있는 전쟁에 대해서는 아는 바가 없었다. 섬의 신관 집안의 사라 노무는 외부인인 쿠도우에 대해 반감을 표시하지만, 그녀의 동생인 마오 노무는 따분한 섬생활에 지겨움을 느끼고 그를 반갑게 맞이한다. 한편 섬 주변에서는 외계의 에너지 반응이 포착되어 지구인들의 관심을 집중시키는데...