깊고 평화로운 바다속 나라는 호시탐탐 용궁을 노리던 상어 해적들의 갑작스런 습격으로 순식간에 전쟁터로 변한다. 엎친 데 덮친 격으로 수비대장 태극장군은 전쟁 중에 깊은 상처를 입고 용왕은 충신이라 믿었던 이모겐의 음모로 원인 모를 병에 걸린다. 용왕의 병세가 날로 깊어가자 어린 거북 '해로'는 아버지 태극장군을 대신하여 용왕의 치료약인 토끼의 간을 구하러 미지의 세계, 육지로의 고행 길을 자청한다. 생전 한번 보지 못한 토끼의 몽타쥬를 손에 들고... 낯선 육지에서의 긴 여행에 지친 해로는 숲속의 소녀 '토레미'를 우연히 만나 친구가 되고, 숲속의 대장 자리를 놓고 다투던 토레미, 숏다리 삼총사를 따라 깊은 숲 속 드래곤이 지키고 있는 기적의 열매를 찾아 떠난다. 해로는 같이 떠났던 육지의 친구들과의 목숨을 건 모험 끝에 영원한 우정을 맹세한다. 하지만 토레미가 토끼라는 사실을 뒤늦게 깨달은 해로는 우정과 책임감 사이에서 어쩔 줄을 모르는데...